Ну вообще-то схемы настройки НДС находятся в SPRO вот в этой ветке, и там думаю вы найдете много интересного... я к сожалению не специалист по финансовому, а тем более налоговому учету, но начать можно смотреть отсюда.
PS: Ну и еще пара картинок прицеплю...